Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp5Q8BX09 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms