Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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