Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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