Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp54Q8BL06 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp54Q8BL06 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp54Q8BL06 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp54Q8BL06 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.5 ms