Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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