Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms