Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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