Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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