Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Clec18aQ7TSQ1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms