Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms