Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shq1Q7TMX5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms