Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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