Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms