Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Krt40Q6IFX3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Krt40Q6IFX3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Krt40Q6IFX3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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