Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms