Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkp4Q68FH0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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