Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms