Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms