Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms