Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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