Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Urb1Q571H0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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