Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pydc3Q3V3Q4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pydc3Q3V3Q4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pydc3Q3V3Q4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Pydc3Q3V3Q4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pydc3Q3V3Q4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pydc3Q3V3Q4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pydc3Q3V3Q4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms