Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms