Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam35aQ3UEN2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms