Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms