Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms