Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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