Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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