Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms