Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Thbs3Q05895 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Thbs3Q05895 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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