Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms