Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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