Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms