Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms