Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F8a1Q00558 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms