Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mesp1P97309 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms