Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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