Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gbx1P82976 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms