Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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