Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms