Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gabra1P62812 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms