Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Abce1P61222 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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