Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rad23aP54726 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms