Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms