Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
FmodP50608 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms