Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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