Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VdrP48281 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms