Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms