Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gli1P47806 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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