Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pax9P47242 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms